大明國行政機構遷移到南京城，并開始改制的時候，石達開率領的五萬先鋒軍，以及左宗棠率領的五萬平北軍，就開始出征了。

　　部分原南京城方面占據的地區，在得到了南京城被大明攻破，陳太平投誠的消息，以及陳太平說‘華夏不歸上帝管’所有人都該服從大明國統治的時候，就直接選擇了投誠。

　　也有少部分不愿意投誠的地區，在先鋒軍和平北軍的大軍面前，也終于認清了現實選擇投降，或者是被攻占。

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