話說，有關蹇碩所征用的這些人，在當世都是已經具有相應知名度的人物了，各自都具有其自身本有的一些才智和能力。而蹇碩能夠順利的招到并任用他們，也可以想見其本身還是具有一些識人用人的才能的。
司徒許相的任職已經到期，便改換了司空丁宮來擔任司徒，由光祿勛劉弘出任司空。于此同時，靈帝任命衛尉董重為驃騎將軍，職權與何進等同，但職位上要稍次于何進。董重是靈帝生母董太后的兄長即靈帝親舅舅的兒子，所以此時任命董重一事含有與何氏一派分權的目的，至少可以在職權事務上進行牽制一下。
于此之時，青州與徐州兩地的黃巾軍又起來作亂，并寇掠周邊各郡縣。朝廷任用焦和為青州刺史，任用陶謙為徐州刺史，負責各自平討本州境內的黃巾軍。
是時，負責觀察天象的天文官發現京師上空有兇煞之氣生成，認為將可能會有兵災事件發生。靈帝以為這可能是指京師的軍事武備出現了相應疏漏，會導致叛軍攻入京師地界，又或者是外戚一派的何氏姊妹可能將會有所動作，準備要發動兵變了也不一定；而不管是哪種原因，靈帝都覺得有必要加以應對一下，于是便下詔讓各地派遣大軍入京，來增強京師的軍事防御。
此時靈帝自稱為無上將軍，要求所有軍隊的將領和士卒都要接受他的調度指揮，且在平樂觀下筑建了高臺和演武場，準備要在這里挑選精銳猛士來填充西園校軍的軍事力量。彼時靈帝召蓋勛前來詢問，對于他此番的軍事運籌有沒有什么必要的補充意見。對此蓋勛倒還真是有點意見，他認為叛賊當前都在遠處攻城略地，在京師聚集大軍是不能起到威懾作用的，而應該把將士們都派出去征討叛賊，這樣才可以使各方的叛亂勢頭逐漸平息下來。靈帝認為蓋勛說的有道理，就稍稍的調整了一下方略，開始調集各地的弱兵到京師來接受教官王越的調訓，而后對于調訓合格的便輸送到四方去參加作戰，以使眾將士可以有機會去建功立業。
由于蓋勛的意見受到靈帝的重視，就不免也引起了一旁其他人的注意，比如那個喜歡結交四方名士的袁紹，就主動與蓋勛進行了接洽，并向其詢問當前國家內部問題的真正根源所在究竟是什么。對于這個問題蓋勛的回答很簡單明了，最根源的問題所在就是當前的宦官，身為天子的近侍卻借助于天子的權威弄威作福，且肆意操控國家原本正常的運作，最終導致叛亂頻發削弱了漢室王朝的命脈，這對漢王朝而言是極大的罪責。袁紹認為蓋勛說的很對，就跟其一同商討關于如何謀除宦官的一干計劃，但這個事情被蹇碩得知了，害怕他們會在關鍵的節骨眼上搞出不必要的亂子，于是向靈帝奏請任用蓋勛為京兆尹，于是這個計劃被暫時擱置下來。
王國率眾進圍陳倉，陳倉形勢危急。而于此之時，那張舉所部也像事先商量好的一樣，同時揮軍南下，十幾萬大軍兵分四路，一路留守幽州攻略所余郡縣，三路南下攻打冀州，并隨后繼續分出兩路攻打青州，且繼而又分出一路去攻打徐州。
針對于此種情況，靈帝便下詔重新啟用皇甫嵩，任命其為左將軍，與已提升為前將軍的董卓合兵四萬，共同討伐王國所部。任命公孫瓚為騎都尉，與南匈奴左賢王部協助劉虞應對幽州一部張舉大軍；又任命泰山人臧霸為騎都尉，協同陶謙由徐州方面向北阻擊其部一路張舉大軍的南下。
而據此布置，即使各州郡縣不幸失守，只要北部幽州一路的張舉大本營被消滅，再一路南下，與陶謙所部方面即可形成戰略包夾之勢。而唯獨比較有問題的是，便是青、徐兩州的黃巾軍也于此時正在作亂，如果這兩方人馬這時選擇合作，那么對于朝廷這方而言就會立時變得非常棘手。不過好在張舉軍大多都是外部少數異族，與黃巾軍之間的信仰及立場都完全不同，且黃巾軍本身也十分的排斥外族，因而他們之間尚且沒有聯合的可能情況，目前屬于各自為戰且有可能產生相互摩擦的一種狀態。
公孫瓚帶隊與張純一部交戰于遼東石門山一帶，張純被公孫瓚擊敗，立時向后撤退，并退往遼西地界，在管子城這里駐防。而說到此處，需得提一下劉關張三人那方，因劉備在安熹縣尉任上工作績效不合而可能遭到篩汰，于是劉備想要求見擔負篩查職事的都郵，但那都郵彼時不太想見劉備，便以身體不適為由拒絕與其見面。之后劉備確定被入于遭篩汰的行列，于是一氣之下便將那都郵給抓了起來，然后捆在了樹上，再先是毒打了一頓，然后又因對方不從而準備要將其殺掉，但由于對方苦苦哀求隨即又心頭一軟，便立時收手而選擇棄職離去，隨后即又投奔在了公孫瓚的帳下。
之后公孫瓚又繼續進軍，想要一舉端掉張舉老巢；隨后在管子城這里與張純交戰，公孫瓚又擊敗張純并攻克了管子城，但隨后卻又陷入到了丘力居的重重圍困之下。由于公孫瓚在隨后的交戰中始終無法突破重圍，導致整個局面的形勢逐漸變得有些岌岌可危，因而靈帝害怕預先部署的局勢被破解，但又實在沒有其它辦法，就只好連夜下詔送至呂布處，希望其可以抽身帶隊前往遼西解圍。
呂布在收到靈帝的詔令后，知道當前幽州方面的形勢不可有失，于是便立時做了相應的籌劃安排。他先派人送信到鮮卑步根度那方進行聯絡，如果對方那里可以幫忙牽制漠北那方的戰略形勢，那么作為回報他將可以協助他統一漠北成為鮮卑唯一的首領，而這事得到了步根度那方的應許。隨后雙方締結了契約，又做好了相應的內務安排后，呂布便率李肅等前往幽州支援公孫瓚。
而于此之時，皇甫嵩那方在到任后遲遲未有出兵救援陳倉的舉動，于是董卓就立時向其提議此時陳倉正被叛軍急攻，如果他們可以及時派軍從側后方發動突襲，則必然可以出其不意擊破叛軍。然后皇甫嵩卻表示陳倉的地勢險要且防御堅固，一時半會兒沒那么容易被攻下來，而眼下叛軍的銳氣正盛，應當等其銳氣衰落之時再行出擊。
之后，王國圍攻陳倉一連將近兩個月都無法攻破，準備要率眾離去。這時皇甫嵩眼見機會來了，便準備要率部出擊，而董卓卻認為這時并不適合出擊，但皇甫嵩不以為然，而自顧率本部兩萬人馬前往追擊。隨后，皇甫嵩與王國所部交戰，卻遭遇韓遂馬騰兩部分兵夾擊。而彼時董卓已率部殿后，所以便又反向包夾了韓遂馬騰兩部。于是皇甫嵩擊破王國，隨后又調頭與董卓夾攻韓遂馬騰，兩部人馬立時撤退，陳倉之圍徹底疏解。
事后皇甫嵩想要與董卓致歉，但董卓卻并不領情，且批其與張溫一樣是根本在不懂裝懂，且表示其二人今后各干各的，以防彼此間相互干擾。原本董卓與皇甫嵩之間的關系還算不錯，但就因為這個事情，兩人之間出現了分化，并在之后逐漸開始離隙。
由于王國此番指揮失策，手下損失了上萬人馬，導致兵勢一下弱于其他人，于是便被韓遂馬騰等人趁勢廢黜了首領之位。之后，他們又劫持了前信都縣令漢陽人閻忠，想讓閻忠來當他們的新任首領。但閻忠隨后莫名死亡，經仵作檢驗說是罹患惡疾而死的。由于無人可以再被推舉出來成為新的首領，于是各部首腦自相舉薦，都想成為這新的首領；隨后各方開始紛爭，勢力逐漸衰落，暫時無法再對漢朝這方起到威脅與影響。