彼時，董卓讓王允給自己推薦一個辦事效率比較高的人選來出任司隸校尉一職，王允便立時推薦了時任京兆尹的蓋勛。對此，董卓則認為蓋勛的個人立場與他不同，而且為人明智能說會道，如果給他這種比較重要的職權，可能將會對他們此番的計劃產生不利。隨后董卓便忽然想起了之前和他有矛盾的皇甫嵩，此時正領兵三萬屯駐于扶風地界，于是就征召蓋勛出任議郎，然后征召皇甫嵩來擔任司隸校尉的職事。
是時蓋勛暗中與皇甫嵩進行商議，認為他們此時可以響應關東聯軍，從西路對董卓那邊進行戰略包夾。對此，皇甫嵩的長史梁衍也提出了認同的建議，認為董卓強占京師竊據朝政，擅自違背漢家傳統而行廢立之為，此有罪于漢室；如今其又發出征召，對此若不假思量即前往赴事，往大處說這可能會引生災禍，往小了說則也可能會招致屈辱；所以如果此番拒絕征召，則一旦天子起駕來西，這方即立時率大軍前往迎接，而后奉王令以討逆臣，再與關東袁紹等眾遙相呼應兩相配合，從東西兩路進行包夾，則定然可以使其就此成擒，這是極大的功勛。
對于兩人所提出的意見和分析，皇甫嵩仔細考慮了下，認為這個事情本身仍有較大風險。且不說后方還有韓遂馬騰等西羌叛軍尚未完全平息，而即使后方無憂，也未必就一定能夠在正面與董卓的交手中獲勝。況且如今還有并揚等州并未參與到反對董卓的陣營里去，而關東聯軍也未見其同屬一心，所以倘若這時有其他州部派兵從后方包夾他們的話，則形勢上也必然將會十分危險。所以皇甫嵩思來想去覺得這個事情目前還不大好干成，尤其是皇帝并沒有下令要誅討董卓，這種情況說到底都很難算事的，因而皇甫嵩最終拒絕了這個提議。
之后，皇甫嵩便動身前往洛陽接受了任命。而蓋勛因為孤立無援又力量薄弱，所以也只能先放棄這個打算，然后也動身前往洛陽接受任命。而這時河南尹朱儁向董卓提出建議，認為他們應該謹守關隘險道，與對方打持久消耗的戰勢，然后才可以有取勝的希望。
對于朱儁所言，那董卓卻立時發出斥責，說他自己一生經歷百戰，從來沒有真正失敗過，可謂是百戰百勝；所以不要隨便在這里亂說話，不然其體內的鮮血將會玷污他手中的寶刀。然而這個事情卻立時遭到了蓋勛的指責，說即使連昔日圣明的武丁都要主動去尋求聽取別人的意見，難道你比武丁還要厲害，讓別人連說話的權利都沒有了嗎。
董卓與蓋勛也是老相識了，知道蓋勛這人的個性與脾氣，所以就不想惹出口舌之爭，就直接表達了適當的歉意，然后同時又委任蓋勛出任了越騎校尉一職。然而就在這時，忽然有人前來匯報，說捉住了司馬防之子司馬朗舉家潛逃，可能意圖要去投靠袁紹所部關東聯軍。
司馬朗是司馬防的長子，戶籍歸屬是河內溫縣。此時司馬防尚在朝中擔任治書御史之職，因而此時就出來向董卓陳述辯解，說當今天下形勢大亂，為了避免兵禍會波及家人，所以才讓長子司馬朗攜家眷回往家鄉避難；順勢再置以蓄馬之業，在給朝廷供應軍需的同時，也順帶給家中添些收入，因而并無投奔關東聯軍的意圖。
談起司馬朗是司馬防的長子，令董卓也忽然想起了自己曾經也有個長子，但因故早逝，所以他隨后就要求讓那司馬朗前來給他見一見。而后一見之下，他就立時有些感慨，認為這個司馬朗與自己那個長子的年歲相同，而如果他那長子到現在還能活著的話，恐怕兩人看起來應該相差不多。由于董卓有點欣賞司馬朗，所以就想要將他給留在身邊，但司馬朗卻認為董卓必然會最終失敗覆滅，所以就很擔心自己會被滯留下來，因而就花了不少錢去打點董卓手下的一些親信人員，最終就將他給放還歸鄉了。
之后，司馬朗在舉家返回家鄉以后，就跟家鄉的父老鄉親分析了當前的形勢，認為整個司州境內都不再安全，尤其距離此處不遠的成皋那里是兵家必爭之地，所以他就提議所有人都往黎陽那里搬遷，那里要更安全一些。然而對于司馬朗所分析的雖然鄉親們都認為是有道理的，但終究也還是舍不得放棄手頭的那點家業，因而最終只有司馬朗攜家人舉家遷居到了黎陽。
隨后，遷都的事宜正式執行，洛陽城中有不少財大氣粗的富豪人家不愿意遷走，于是董卓就下令將他們全部逮捕，然后以謀逆的罪名予以處死，并抄沒了他們的家產，老婆孩子等家屬一些的都被充軍處置。而由于最剛硬的一批人都被殺死了，所以后面的人都沒敢再加以反抗，只能順著董卓大軍的驅趕，而舉家往長安遷去。但由于人數眾多，道路擁擠，又催促太急，而導致有踩踏事件發生，然后還有饑餓與搶掠的情況，最后導致了許多人都死在了路上。
而當所有人都全部遷出完畢后，董卓又帶領胡軫等手下的直系部曲開始放火焚燒整個京師所有的房屋住宅，包括皇城宮殿、京城官邸和各處民宅等，總之是應毀盡毀，兩百里范圍內全部焚燒殆盡。然后因為手下的人員都不懂如何正確的發掘陵墓，而呂布本身剛好了解一些風水堪輿等玄術方面的門道，所以又調派呂布前來負責勘察破解陵墓，以方便其帶人盜撅墓中的陪葬品，然后獲取了不少的珍貴財寶。
原本討董聯軍的東路軍那方是打算要先進占成皋再進攻汜水關的，但因為得知呂布帶隊前去協防，所以各個將領又開始猶疑起來，以至于又臨時停止了原本要進軍的意向。而董卓是時得知東路聯軍并未有實際出兵進攻成皋與汜水關，就覺得這些人可能都是些膽小如鼠之徒，因而就認為這些人眼下還并不足以為懼，所以才又調派呂布回來，而僅留張遼負責在汜水關協防徐榮所在的成皋城那方。
之后，在經過大概一個月的長途跋涉，劉協的車駕順利的抵達了長安，然后先在京兆尹的府邸暫行下榻，等到宮殿被修繕完畢了以后，才又正式搬到了宮殿里居住。由于王允凡事都按照董卓的意思去辦理，所以董卓對他非常的信任，并將遷置于長安之后的大小事務都全權委托給他來負責。而由于王允本身能上能下，大事小事都干得非常周詳到位，所以包括劉協在內從上到下的所有人都非常依靠于他，事事都要委托于他來進行安排置辦。
由于袁紹袁術等人聚眾討伐董卓的緣故，太傅袁隗一家受到了牽連，包括太仆袁基等一家老小在內，共五十多口人都被董卓下令給處死了。而這事傳到了袁紹與袁術那里以后，自然就引起了他們的震顫與憤怒，并紛紛發誓一定要屠滅董卓以報滅族之仇。
荊州刺史王睿曾與孫堅一起討伐零陵和桂陽等地的盜賊，但彼時的王睿因為孫堅是個武人且沒有什么文化而輕視怠慢于他，所以此時兩人的矛盾就逐漸的凸顯了出來。而這時王睿與武陵太守曹寅之間又有矛盾，因為曹寅不能執行他的命令參與討董聯盟，所以王睿就準備要殺死曹寅。而這時曹寅就主動與孫堅聯絡，并偽造了朝廷辦案的文書讓孫堅拿去作為殺死王睿的依據，然后孫堅就拿著偽造的文書去了。
之后孫堅率部抵達南陽，對王睿宣告要按罪攻伐于他，然后王睿就驚問自己犯了什么罪，孫堅就表示并不清楚他犯了什么罪，只是朝廷的使者發了這樣一個伐罪文書而已。于是王睿被逼無奈之下，只好選擇自殺身亡。而王睿死了以后，盡管孫堅又通過誘擊的方式殺死了南陽太守張咨，并因此而獲得了南陽城中一時的供給，但始終無法完全據有這塊地盤，所以他隨后就將這塊地盤送給了袁術。于是，孫堅移軍魯陽駐扎，袁術則進駐南陽城內，并舉薦委任孫堅為破虜將軍，而后繼續為其提供后續的軍需補給。