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　　阿紫攜蕭峰跳崖，卻再一次如蕭遠山落在澗溪之中。經過珍瓏一戰，逍遙派人才凋零，蘇星河中毒而死。

　　心灰意冷的薛慕華恰巧路徑澗溪，救起墜崖的阿紫，卻意外發現蕭峰一氣未絕。而親眼目睹大哥自折性命而息宋遼之戰的段譽虛竹二人，虛竹攜妻遠離中原，返回天山縹緲峰，生子:李越綺。段譽攜眾女返回大理，內修理政，外接蕃夷，逍遙快活，生女:段嫣萱。

　　經過薛慕華的悉心照料，蕭峰，阿紫完全復原，蕭峰經過懸死之戰，心卻解脫釋然，收漢人:獨孤鴻為義子。

　　獨孤鴻自小天賦異稟，十歲乃遇蕭峰阿紫掉崖時所現之神雕，十五歲貫通蕭峰降龍十八掌。恰是那時，中原武林再現漣漪，而甘為蕭峰前后的薛慕華知蕭峰心系武林，將武林再現蒙面神秘人之事告知蕭峰。恰時，獨孤鴻外出歷練之心得阿紫支持。蕭峰不置可否，薛慕華贈逍遙派醫經一卷。途經無涯洞，得后十年縱橫天下之劍—紫薇。

　　而此時段譽之女—段嫣萱好奇貪玩，踏足中原。于無名島結識正值風華的獨孤鴻。兩人并不知父輩互為異兄，段女喜愛通靈神雕，想盡辦法要把神雕策反，卻搞得啼笑皆非。兩人歷經磨難，中途幾次遭遇蒙面人襲擊，而蒙面人所使之內功乃少林內經。一則為了調查實情，二則為了探望已經過百的義祖蕭遠山，兩人齊向少林出發。

　　期間歷經挫折，獨孤鴻功力大增，而蒙面人每次只是試探性攻擊，并不痛下殺手，使得兩人頗為奇怪。及至少林，才發現路途蒙面之人乃蕭峰所扮，意在磨練獨孤鴻，和查清此次武林動蕩之根本。兩人再遇被虛竹派出歷練的李越綺，三人于少林再結異性兄妹，一起前往無名島調查武林之患。

　　自此，一場驚天陰謀開始醞踉，段嫣萱遇書生黃裳，李越綺誤魔弒父，此時獨孤鴻已身兼數家武學，于蒼茫山摘得重劍（后楊過所使之劍）。

　　武林浩劫出，段嫣萱身死，黃裳身心憤懣，入武學，乃注九陰真經，于無名島手刃仇人，自此隱居一生，改無名島為—桃花島。

　　獨孤鴻九入遼國，替宋解圍，卻為漢官所憎，遭武林惡徒圍攻，心意惘然，殺眾惡徒，領神雕入無涯洞，及至四十出，徒手無敵，融降龍十八掌為獨孤九劍，改名獨孤求敗。乃埋眾劍于無涯洞，清涼終身。